Данный анимационный сериал представляет историю о том, как человечество оказывается на грани вымирания. Великий ледник растаял из-за очередного удара. Половина жителей планеты погибло, а оставшиеся в живых личности подверглись нападению со стороны могущественных существ Ангелов. Ученые решили создать роботов, которые являются единственным действующим оружием против сильных созданий. Протагонист данной истории отправился к своему отцу, являющемуся управляющим организации Нерв, который начал активно вести борьбу против ангелов. Родственник не смог предложить определенную поддержку собственному сыну. Синдзи будучи подростком придется стать водителем робота, чтобы встать на борьбу против врага. Данная часть рассказывает о секретах последних событий, произошедших в сериале.